Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA11Q9UKX5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms