Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms