Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYTH4Q9UIA0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CYTH4Q9UIA0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYTH4Q9UIA0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYTH4Q9UIA0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYTH4Q9UIA0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYTH4Q9UIA0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYTH4Q9UIA0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYTH4Q9UIA0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYTH4Q9UIA0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYTH4Q9UIA0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYTH4Q9UIA0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYTH4Q9UIA0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYTH4Q9UIA0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYTH4Q9UIA0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYTH4Q9UIA0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYTH4Q9UIA0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYTH4Q9UIA0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms