Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNNA3Q9UI47 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms