Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms