Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKD2L1Q9P0L9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms