Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms