Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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RDH8Q9NYR8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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RDH8Q9NYR8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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RDH8Q9NYR8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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RDH8Q9NYR8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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RDH8Q9NYR8 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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RDH8Q9NYR8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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