Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY46

SCN3A, Sodium channel protein type 3 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN3AQ9NY46 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN3AQ9NY46 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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