Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms