Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT57Q9NWB7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms