Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPRSS4Q9NRS4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPRSS4Q9NRS4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPRSS4Q9NRS4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPRSS4Q9NRS4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPRSS4Q9NRS4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPRSS4Q9NRS4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPRSS4Q9NRS4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPRSS4Q9NRS4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPRSS4Q9NRS4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPRSS4Q9NRS4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPRSS4Q9NRS4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPRSS4Q9NRS4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPRSS4Q9NRS4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPRSS4Q9NRS4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPRSS4Q9NRS4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPRSS4Q9NRS4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPRSS4Q9NRS4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPRSS4Q9NRS4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPRSS4Q9NRS4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPRSS4Q9NRS4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPRSS4Q9NRS4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPRSS4Q9NRS4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPRSS4Q9NRS4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPRSS4Q9NRS4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms