Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms