Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPHK2Q9NRA0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPHK2Q9NRA0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPHK2Q9NRA0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPHK2Q9NRA0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SPHK2Q9NRA0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPHK2Q9NRA0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPHK2Q9NRA0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SPHK2Q9NRA0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPHK2Q9NRA0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPHK2Q9NRA0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPHK2Q9NRA0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPHK2Q9NRA0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPHK2Q9NRA0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPHK2Q9NRA0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPHK2Q9NRA0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPHK2Q9NRA0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
SPHK2Q9NRA0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms