Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BCAS3Q9H6U6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms