Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM8Q9BZR9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms