Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms