Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms