Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
HERPUD2Q9BSE4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms