Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms