Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPS8Q99627 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPS8Q99627 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPS8Q99627 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPS8Q99627 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
COPS8Q99627 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPS8Q99627 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPS8Q99627 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPS8Q99627 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPS8Q99627 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPS8Q99627 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPS8Q99627 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPS8Q99627 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COPS8Q99627 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
COPS8Q99627 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
COPS8Q99627 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COPS8Q99627 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COPS8Q99627 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
COPS8Q99627 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COPS8Q99627 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COPS8Q99627 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COPS8Q99627 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COPS8Q99627 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COPS8Q99627 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS8Q99627 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms