Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms