Protein–RNA interactions for Protein: Q96S99

PLEKHF1, Pleckstrin homology domain-containing family F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHF1Q96S99 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PLEKHF1Q96S99 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLEKHF1Q96S99 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLEKHF1Q96S99 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms