Protein–RNA interactions for Protein: Q96S21

RAB40C, Ras-related protein Rab-40C, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40CQ96S21 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB40CQ96S21 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms