Protein–RNA interactions for Protein: Q96P50

ACAP3, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP3Q96P50 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms