Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TSNARE1Q96NA8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms