Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC43Q96MW1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms