Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms