Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms