Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms