Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms