Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms