Protein–RNA interactions for Protein: Q96HA7

TONSL, Tonsoku-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TONSLQ96HA7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TONSLQ96HA7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TONSLQ96HA7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms