Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EDC3Q96F86 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
EDC3Q96F86 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDC3Q96F86 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDC3Q96F86 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDC3Q96F86 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDC3Q96F86 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDC3Q96F86 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDC3Q96F86 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDC3Q96F86 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDC3Q96F86 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDC3Q96F86 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDC3Q96F86 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDC3Q96F86 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDC3Q96F86 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDC3Q96F86 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDC3Q96F86 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDC3Q96F86 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDC3Q96F86 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDC3Q96F86 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDC3Q96F86 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDC3Q96F86 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDC3Q96F86 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDC3Q96F86 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDC3Q96F86 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDC3Q96F86 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDC3Q96F86 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDC3Q96F86 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDC3Q96F86 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDC3Q96F86 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDC3Q96F86 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDC3Q96F86 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDC3Q96F86 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDC3Q96F86 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDC3Q96F86 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDC3Q96F86 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDC3Q96F86 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDC3Q96F86 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDC3Q96F86 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDC3Q96F86 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDC3Q96F86 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDC3Q96F86 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDC3Q96F86 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDC3Q96F86 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDC3Q96F86 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDC3Q96F86 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDC3Q96F86 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDC3Q96F86 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDC3Q96F86 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms