Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC97Q96F63 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC97Q96F63 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC97Q96F63 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC97Q96F63 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC97Q96F63 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC97Q96F63 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC97Q96F63 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC97Q96F63 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC97Q96F63 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC97Q96F63 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC97Q96F63 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC97Q96F63 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC97Q96F63 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms