Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC10A4Q96EP9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC10A4Q96EP9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC10A4Q96EP9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC10A4Q96EP9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC10A4Q96EP9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC10A4Q96EP9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC10A4Q96EP9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC10A4Q96EP9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC10A4Q96EP9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC10A4Q96EP9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC10A4Q96EP9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC10A4Q96EP9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC10A4Q96EP9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC10A4Q96EP9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC10A4Q96EP9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC10A4Q96EP9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC10A4Q96EP9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC10A4Q96EP9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms