Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms