Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms