Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RTP4Q96DX8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RTP4Q96DX8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RTP4Q96DX8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RTP4Q96DX8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RTP4Q96DX8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RTP4Q96DX8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RTP4Q96DX8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RTP4Q96DX8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTP4Q96DX8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTP4Q96DX8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTP4Q96DX8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RTP4Q96DX8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTP4Q96DX8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTP4Q96DX8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTP4Q96DX8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RTP4Q96DX8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTP4Q96DX8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTP4Q96DX8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTP4Q96DX8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTP4Q96DX8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTP4Q96DX8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTP4Q96DX8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTP4Q96DX8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTP4Q96DX8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTP4Q96DX8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTP4Q96DX8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RTP4Q96DX8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms