Protein–RNA interactions for Protein: Q969M2

GJA10, Gap junction alpha-10 protein, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA10Q969M2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA10Q969M2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJA10Q969M2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJA10Q969M2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJA10Q969M2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJA10Q969M2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJA10Q969M2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJA10Q969M2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJA10Q969M2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJA10Q969M2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA10Q969M2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA10Q969M2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA10Q969M2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA10Q969M2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA10Q969M2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA10Q969M2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA10Q969M2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA10Q969M2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA10Q969M2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA10Q969M2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA10Q969M2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA10Q969M2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA10Q969M2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA10Q969M2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA10Q969M2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA10Q969M2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA10Q969M2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA10Q969M2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA10Q969M2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms