Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMPDL3AQ92484 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms