Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVX3

C4orf3, Uncharacterized protein C4orf3, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf3Q8WVX3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms