Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms