Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ANKRD53Q8N9V6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms