Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IGSF1Q8N6C5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms