Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4L8

CCDC24, Coiled-coil domain-containing protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC24Q8N4L8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC24Q8N4L8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC24Q8N4L8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms