Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U4

STAG2, Cohesin subunit SA-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG2Q8N3U4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
STAG2Q8N3U4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms