Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RPUSD2Q8IZ73 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPUSD2Q8IZ73 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPUSD2Q8IZ73 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPUSD2Q8IZ73 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPUSD2Q8IZ73 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPUSD2Q8IZ73 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPUSD2Q8IZ73 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPUSD2Q8IZ73 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPUSD2Q8IZ73 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPUSD2Q8IZ73 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPUSD2Q8IZ73 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPUSD2Q8IZ73 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPUSD2Q8IZ73 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPUSD2Q8IZ73 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPUSD2Q8IZ73 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPUSD2Q8IZ73 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPUSD2Q8IZ73 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPUSD2Q8IZ73 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPUSD2Q8IZ73 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPUSD2Q8IZ73 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPUSD2Q8IZ73 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPUSD2Q8IZ73 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPUSD2Q8IZ73 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms