Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV77

CNGA4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA4Q8IV77 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA4Q8IV77 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms