Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NME9Q86XW9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NME9Q86XW9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NME9Q86XW9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NME9Q86XW9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NME9Q86XW9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NME9Q86XW9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NME9Q86XW9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NME9Q86XW9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NME9Q86XW9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NME9Q86XW9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NME9Q86XW9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
NME9Q86XW9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NME9Q86XW9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms